Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trim40Q3UWA4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms