Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Slfn4Q3UV66 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms