Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fchsd2Q3USJ8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms