Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28047Q3US59 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms