Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Acsf3Q3URE1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acsf3Q3URE1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms