Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3UPC7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Q3UPC7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3UPC7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3UPC7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UPC7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms