Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Tmem253Q3UNB8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tmem253Q3UNB8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tmem253Q3UNB8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Tmem253Q3UNB8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Tmem253Q3UNB8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Tmem253Q3UNB8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Tmem253Q3UNB8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Tmem253Q3UNB8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Tmem253Q3UNB8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Tmem253Q3UNB8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem253Q3UNB8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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