Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrch2Q3UMG5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrch2Q3UMG5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrch2Q3UMG5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrch2Q3UMG5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrch2Q3UMG5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrch2Q3UMG5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrch2Q3UMG5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrch2Q3UMG5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrch2Q3UMG5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrch2Q3UMG5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrch2Q3UMG5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrch2Q3UMG5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrch2Q3UMG5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrch2Q3UMG5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrch2Q3UMG5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms