Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms