Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctsll3Q3ULP7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ctsll3Q3ULP7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms