Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CrxosQ3UL53 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CrxosQ3UL53 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms