Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms