Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Puf60Q3UEB3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms