Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Yipf3Q3UDR8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms