Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms