Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U6N9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U6N9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U6N9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U6N9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q3U6N9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3U6N9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U6N9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U6N9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U6N9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U6N9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U6N9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms