Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hectd3Q3U487 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms