Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klhl21Q3U410 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms