Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Otud5Q3U2S4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud5Q3U2S4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Otud5Q3U2S4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Otud5Q3U2S4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Otud5Q3U2S4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Otud5Q3U2S4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Otud5Q3U2S4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud5Q3U2S4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud5Q3U2S4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud5Q3U2S4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud5Q3U2S4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud5Q3U2S4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud5Q3U2S4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud5Q3U2S4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud5Q3U2S4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud5Q3U2S4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms