Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vars2Q3U2A8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vars2Q3U2A8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms