Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc9Q3U0M1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms