Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pip4p1Q3TWL2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms