Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ccdc136Q3TVA9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms