Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CiartQ3TQ03 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CiartQ3TQ03 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CiartQ3TQ03 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CiartQ3TQ03 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CiartQ3TQ03 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CiartQ3TQ03 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CiartQ3TQ03 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CiartQ3TQ03 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms