Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Smarca4Q3TKT4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Smarca4Q3TKT4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Smarca4Q3TKT4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms