Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trappc13Q3TIR1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc13Q3TIR1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms