Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2afvQ3THW5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2afvQ3THW5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms