Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Jmjd8Q3TA59 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Jmjd8Q3TA59 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms