Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VrtnQ3SYK4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VrtnQ3SYK4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms