Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zbtb38Q3LR78 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zbtb38Q3LR78 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zbtb38Q3LR78 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb38Q3LR78 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb38Q3LR78 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb38Q3LR78 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb38Q3LR78 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb38Q3LR78 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb38Q3LR78 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb38Q3LR78 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbtb38Q3LR78 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms