Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Riiad1Q3KNY5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Riiad1Q3KNY5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms