Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
H2-M3Q31093 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2-M3Q31093 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms