Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpm1Q2TV84 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm1Q2TV84 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms