Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vax1Q2NKI2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vax1Q2NKI2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms