Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cers3Q1A3B0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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