Protein–RNA interactions for Protein: Q14DH7

Acss3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss3Q14DH7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Acss3Q14DH7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Acss3Q14DH7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms