Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tdrd9Q14BI7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms