Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ptchd1Q14B62 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ptchd1Q14B62 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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