Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rundc1Q0VDN7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rundc1Q0VDN7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms