Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam83bQ0VBM2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam83bQ0VBM2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam83bQ0VBM2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam83bQ0VBM2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam83bQ0VBM2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam83bQ0VBM2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam83bQ0VBM2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam83bQ0VBM2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam83bQ0VBM2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam83bQ0VBM2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam83bQ0VBM2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam83bQ0VBM2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam83bQ0VBM2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam83bQ0VBM2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam83bQ0VBM2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam83bQ0VBM2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam83bQ0VBM2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam83bQ0VBM2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam83bQ0VBM2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam83bQ0VBM2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam83bQ0VBM2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam83bQ0VBM2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam83bQ0VBM2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms