Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Lrriq1Q0P5X1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrriq1Q0P5X1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Lrriq1Q0P5X1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms