Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Plac8l1Q08EJ0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms