Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbp2Q08652 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms