Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc4Q08624 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc4Q08624 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms