Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Calb2Q08331 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calb2Q08331 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms