Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm3Q08189 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm3Q08189 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms