Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
F13bQ07968 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
F13bQ07968 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
F13bQ07968 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13bQ07968 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F13bQ07968 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms