Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AmbpQ07456 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms