Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp2Q06649 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sh3bp2Q06649 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms