Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cab39Q06138 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms